จากการเก็บตัวอย่าง 738 ตัวอย่างจากตลาดค้าสัตว์ปีก 3 แห่งในเซี่ยงไฮ้ ซึ่งมีรายงานว่าพบการเสียชีวิตของมนุษย์จากโรคนี้เป็นครั้งแรกนั้น ได้ตรวจพบไวรัสไข้หวัดนกสายพันธุ์ H7N9 จำนวน 20 สายพันธุ์ ซึ่งรวมถึง 10 สายพันธุ์จากไก่, 3 สายพันธุ์จากนกพิราบและ 7 สายพันธุ์จากตัวอย่างในสภาพแวดล้อม
นายหยู กังเซิน หัวหน้าสัตวแพทย์ของรัฐบาล กล่าวว่าเป็นครั้งแรกที่กระทรวงเกษตรตรวจพบไวรัสในสัตว์ท้องถิ่นภายในประเทศ และได้เสริมว่า จะค้นหาความเชื่อมโยงระหว่างไวรัสที่พบในสัตว์ปีกและไวรัสที่พบในมนุษย์ต่อไป
ทั้งนี้ กระทรวงเกษตรของจีนยังไม่ชี้ชัดเรื่องความเป็นไปได้ของการติดเชื้อในสัตว์ในภูมิภาคอื่นๆและเรียกร้องให้จับตาดูสัตว์ที่ขนส่งข้ามประเทศ สำนักข่าวซินหัวรายงาน