ทั้งนี้ นายกรัฐมนตรียังได้กำชับให้แบ่งพื้นที่การปฏิบัติงานช่วยเหลือผู้ประสบภัย โดยกำหนดหน่วยงานรับผิดชอบหลักให้ชัดเจน อีกทั้งให้จังหวัดจัดโซนนิ่งพื้นที่น้ำท่วมและวางแนวทางการช่วยเหลือให้สอดคล้องกับระดับความรุนแรงและสถานการณ์อุทกภัยในแต่ละพื้นที่ พร้อมให้หน่วยงานที่เกี่ยวข้องสนับสนุนการปฏิบัติงานตามพื้นที่โซนนิ่งของจังหวัด
นอกจากนี้ ได้เน้นย้ำให้กระทรวงมหาดไทย โดยกรมป้องกันและบรรเทาสาธารณภัย (ปภ.) ร่วมกับจังหวัดดูแล ให้การช่วยเหลือ เยียวยาบรรเทาความเดือดร้อนผู้ประสบภัยอย่างต่อเนื่องจนกว่าสถานการณ์จะคลี่คลายเข้าสู่ภาวะปกติ เพื่อมิให้เกิดช่องว่างในช่วงรอยต่อของสถานการณ์ พร้อมเร่งสำรวจความเสียหายของพื้นที่ครอบคลุมทั้งบ้านเรือน ทรัพย์สินและพื้นที่การเกษตรไว้ล่วงหน้า เพื่อให้การช่วยเหลือผู้ประสบภัยเป็นไปอย่างรวดเร็ว ทั่วถึง เป็นธรรม ครอบคลุมทุกพื้นที่
สำหรับสถานการณ์ตั้งแต่วันที่ 17 กันยายน 2556 ถึงปัจจุบันเกิดสถานการณ์อุทกภัยรวม 46 จังหวัด 359 อำเภอ 2,265 ตำบล 18,437 หมู่บ้าน ประชาชนได้รับผลกระทบ 1,137,666 ครัวเรือน 3,731,674 คน คิดเป็นร้อยละ 5.79 ของจำนวนประชากรทั้งประเทศ บ้านเรือนเสียหาย 31,523 หลัง ถนน 5,967 สาย พื้นที่การเกษตรเสียหาย 3,577,078 ไร่ ปศุสัตว์ 4,145,224 ตัว ผู้เสียชีวิต 70 ราย
ขณะนี้สถานการณ์คลี่คลายแล้ว 24 จังหวัด และยังคงมีสถานการณ์อุทกภัย 22 จังหวัด แยกเป็น ระดับรุนแรง 3 จังหวัด ได้แก่ ฉะเชิงเทรา ชลบุรี ปราจีนบุรี ระดับปานกลาง 6 จังหวัด ได้แก่ นครนายก อุบลราชธานี บุรีรัมย์ นครราชสีมา ขอนแก่น และพระนครศรีอยุธยา ระดับเล็กน้อย 13 จังหวัด ได้แก่ ชัยภูมิ ศรีสะเกษ ปทุมธานี นนทบุรี สมุทรปราการ เพชรบุรี สุพรรณบุรี นครปฐม พิษณุโลก พิจิตร สระบุรี ลพบุรี และอ่างทอง