องค์การอนามัยโลก (WHO) กล่าวว่า การฉีดวัคซีนถือเป็นวิธีที่ดีที่สุดสำหรับต่อสู้กับโรคไข้หวัดใหญ่สายพันธุ์ใหม่ 2009 แม้จะมีรายงานการเกิดภาวะข้างเคียงหลังฉีดวัคซีนในประเทศจีน แต่ก็เป็นอัตราที่เล็กน้อยเท่านั้น
เกรกอรี ฮาร์เทิล โฆษกขององค์การอนามัยโลก กล่าวว่า WHO ได้เห็นรายงานแล้วว่ามีผู้ที่ได้รับผลข้างเคียงจากการฉีดวัคซีนต้านไวรัส H1N1 จำนวน 4 ราย จากประชาชนที่ได้รับการฉีดวัคซีนทั้งหมด 39,000 รายในประเทศจีน ซึ่งอาการข้างเคียงที่เกิดขึ้นนั้นได้แก่ ปวดศีรษะและเป็นตะคริว
โฆษก WHO กล่าวว่า การเกิดภาวะข้างเคียงนั้นเป็นเรื่องที่คาดเอาไว้อยู่แล้ว และกล่าวว่าประชาชนโดยเฉพาะผู้ที่ทำงานในภาคสาธารณสุข ควรจะได้รับการฉีดวัคซีน โดยวัคซีนที่ได้รับการคิดค้นและผลิตขึ้นในปัจจุบันถือได้ว่าปลอดภัยที่สุดแล้ว
เขากล่าวว่า ในเร็วๆนี้จะมีการรณรงค์ฉีดวัคซีนในออสเตรเลีย สหรัฐอเมริกา และบางประเทศในยุโรป