ร.ท.หญิงสุนิสา เลิศภควัต รองโฆษกพรรคเพื่อไทย กล่าวยืนยันว่า พ.ต.ท.ทักษิณ ชินวัตร อดีตนายกรัฐมนตรี และรัฐบาลไม่มีส่วนเกี่ยวข้องกับกรณีขอให้ทางช่อง 3 หยุดเผยแพร่ภาพละครเรื่องเหนือเมฆ 2 เพราะไม่มีเหตุผลเพียงพอ รวมถึง พ.ต.ท.ทักษิณ อาศัยอยู่ในต่างประเทศ จึงไม่มีโอกาสได้ดูละครเรื่องดังกล่าวอย่างแน่นอน ดังนั้นพ.ต.ท.ทักษิณ จึงไม่เกี่ยวข้องกับเรื่องนี้
นอกจากนี้ บริษัท บางกอก เอ็นเตอร์เทนเมนต์ ซึ่งเป็นเจ้าของและผู้บริหารของทางช่อง 3 ก็เป็นบริษัทมหาชน ย่อมมีแนวทางบริหารที่ชัดเจน ซึ่งแน่นอนว่ารัฐบาลไม่สามารถเข้าไปแทรกแซงได้ ทั้งนี้การวิพากษ์วิจารณ์รัฐบาลนั้นถือเป็นเรื่องปกติที่รัฐบาลยินดีรับฟัง ไม่ได้มีการปิดกั้นในการพูด จึงไม่มีความจำเป็นที่รัฐบาลจะต้องทำเช่นนั้น