ที่ประชุมคณะรัฐมนตรี (ครม.) มีมติอนุมัติงบประมาณรายจ่ายประจำปีงบประมาณ พ.ศ.2559 งบกลาง รายการเงินสำรองจ่ายเพื่อกรณีฉุกเฉินหรือจำเป็น วงเงิน 1,370,787,100 บาท ให้กองบัญชาการกองทัพไทยและกองทัพบก เพื่อเป็นค่าใช้จ่ายในการดำเนินกิจกรรมโครงการบูรณาการการขุดลอกแหล่งน้ำ ตามนโยบายของรัฐบาลเฉลิมพระเกียรติพระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัว เนื่องในโอกาสมหามงคลเสด็จเถลิงถวัลยราชสมบัติครบ 70 ปี วันที่ 9 มิถุนายน 2559 ตามที่ พล.อ.ประวิตร วงษ์สุวรรณ รองนายกรัฐมนตรีและ รมว.กลาโหม เสนอ
เนื่องจากการดำเนินโครงการบูรณาการการขุดลอกแหล่งน้ำเป็นการดำเนินการในการเตรียมการป้องกันและแก้ไขปัญหาอุทกภัยที่อาจจะเกิดขึ้นในช่วงฟดูฝน รวมทั้งยังสามารถกักเก็บน้ำไว้ใช้ประโยชน์ในการอุปโภค บริโภค และการเกษตรสำหรับช่วงปลายฤดูฝน ซึ่งกระทรวงกลาโหมได้ประสานการปฏิบัติกับหน่วยงานที่เกี่ยวข้องในการเร่งดำเนินการตามโครงการดังกล่าวแล้ว แต่เนื่องจากงบประมาณรายจ่ายประจำปีงบประมาณ พ.ศ.2559 ของกองบัญชาการกองทัพไทย และกองทัพบกมีจำนวนจำกัด ประกอบกับมีแผนงาน/โครงการรองรับไว้ครบถ้วนแล้ว จึงไม่สามารถปรับแผนการใช้จ่ายงบประมาณมาดำเนินการเพื่อการนี้ได้ ดังนั้นเพื่อให้กองบัญชาการกองทัพไทยและกองทัพบกมีงบประมาณรองรับการดำเนินการตามวัตถุประสงค์ของโครงการบูรณาการการขุดลอกแหล่งน้ำจึงเสนอ ครม.พิจารณาอนุมัติหลักการใช้จ่ายงบประมาณรายจ่ายประจำปีงงประมาณ พ.ศ.2559 เพิ่มเติม เพื่อเป็นค่าใช้จ่ายในการดำเนินการดังกล่าวต่อไป