ทั้งนี้ จากความขัดแย้งดังกล่าวจะส่งผลต่อการทำงานของส.อ.ท.มีปัญหาหรือไม่นั้น นายกิตติรัตน์ มองว่า ขณะนี้ต่างยังต้องทำงานร่วมกันอยู่ ดังนั้นอะไรที่จะสามารถเจรจาลดความขัดแย้งลงได้ก็อยากให้ภายในองค์กรของ ส.อ.ท.ไปช่วยกันพิจารณา
ส่วนกรณีที่หยิบยกเรื่องนายพยุงศักดิ์ ไม่ออกมาปกป้องผู้ประกอบการโดยเฉพาะรายกลางและรายย่อยจากการที่รัฐบาลมีนโยบายปรับขึ้นค่าแรงขั้นต่ำ 300 บาททั่วประเทศในปี 56 มาเป็นประเด็นถอดถอนนายพยุงศักดิ์นั้น นายกิตติรัตน์ กลับมองว่า ที่ผ่านมานายพยุงศักดิ์ เป็นผู้ที่มาแสดงความคิดเห็นในเรื่องนี้กับตนมากที่สุด โดยพยายามทั้งคัดค้านแนวทางดังกล่าวรวมทั้งมีข้อเสนอแนะต่อรัฐบาลเพื่อให้ช่วยเหลือผู้ประกอบการที่ได้รับผลกระทบน้อยที่สุดจากการปรับขึ้นค่าแรงขั้นต่ำ 300 บาททั่วประเทศ
นายกิตติรัตน์ ระบุว่า รัฐบาลจะยังถือว่านายพยุงศักดิ์ ชาติสุทธิผล เป็นประธาน ส.อ.ท.อยู่ในขณะนี้ และจะยังทำงานร่วมกับประธานส.อ.ท.คนปัจจุบัน จนกว่าจะมีความชัดเจนในเรื่องนี้