ปัจจัยสำคัญที่ทำให้ต้นทุนปรับตัวสูงขึ้นคือ ค่าแรงงานในการเลี้ยง ซึ่งปรับตัวสูงขึ้นในสินค้าปศุสัตว์ทุกตัวที่ทำการวิเคราะห์ ระหว่างร้อยละ 2.13 - 41.18 ของค่าแรงในไตรมาสสุดท้ายปี 2555 โดยต้นทุนไข่ไก่ปรับตัวสูงขึ้นที่สุดคือ ร้อยละ 41 รองลงมา ได้แก่ น้ำนมดิบ ร้อยละ 23 สุกรร้อยละ 19.48 และไก่เนื้อร้อยละ 2.13 ของค่าแรงไตรมาสสุดท้ายปี 2555
ค่าแรงในการเลี้ยง ไตรมาส 4 ปี 2555 ไตรมาส 1 ปี 2556 อัตราการเปลี่ยนแปลง(%)
ไข่ไก่ (บาท/ฟอง) 0.051 0.072 41.18
น้ำนมดิบ (บาท/กก.) 1.86 2.28 22.58
สุกร (บาท/กก.) 0.77 0.92 19.48
ไก่เนื้อ (บาท/ตัว) 1.41 1.44 2.13อย่างไรก็ตาม พบว่า ค่าอาหารสัตว์ กระทบต่อต้นทุนการผลิตไม่มากนัก เนื่องจากวัตถุดิบอาหารสัตว์หลัก เช่น รำข้าว ข้าวโพดเลี้ยงสัตว์ กากถั่วเหลือง มันสำปะหลัง เป็นต้น มีการปรับขึ้นและลดลงตามสถานการณ์ตลาด
ทั้งนี้ รัฐบาลได้ดำเนินการแต่งตั้งคณะทำงานจัดทำมาตรการลดต้นทุนการผลิตปศุสัตว์แล้วเพื่อช่วยแก้ไขปัญหาด้านต้นทุน การผลิต โดยให้คณะทำงานฯ เร่งดำเนินการทำ Zoning พื้นที่ที่เหมาะสมต่อการเลี้ยงสัตว์ทำการวิจัยเพื่อศึกษาการเลี้ยงโคนมเพศผู้ เพื่อเพิ่มปริมาณเนื้อโคสำหรับบริโภคในประเทศส่งเสริมเผยแพร่การทำก๊าซชีวภาพจากของเสียจากการเลี้ยงสัตว์เพื่อใช้เป็นพลังงาน ทดแทน และเผยแพร่องค์ความรู้จากการปฏิบัติจริงทั้งของภาครัฐและเกษตรกรที่สามารถลดต้นทุนการผลิตได้ ซึ่งขณะนี้คณะทำงานฯ ได้นำเสนอโครงการทำก๊าซชีวภาพจากของเสียจากการเลี้ยงสัตว์ เพื่อใช้เป็นพลังงานทดแทน และโครงการเลี้ยงโคนมเพศผู้เพื่อทด แทนการขาดแคลนเนื้อโคเสนอคณะกรรมการจัดทำมาตรการลดต้นทุนการผลิตสินค้าเกษตรแล้ว