นอกจากนั้นคณะกรรมการฯ ยังต้องพิจารณาเปรียบเทียบข้อดี-ข้อเสียระหว่างการให้เอกชนเป็นผู้จัดหาขบวนรถไฟกับการให้ภาครัฐเป็นผู้จัดหาเอง ซึ่งภาครัฐมีงบประมาณตาม พ.ร.บ.ให้อำนาจกระทรวงการคลังกู้เงิน 2 ล้านล้านบาท เพื่อการลงทุนในโครงสร้างพื้นฐานด้านการขนส่งของประเทศอยู่แล้ว และสามารถใช้เป็นอำนาจในการต่อรองกับเอกชนได้ด้วย
ส่วนรถไฟฟ้าสายสีเขียวอยู่ระหว่างพิจารณาว่าจะต้องเจรจากับ บมจ.ระบบขนส่งมวลชนกรุงเทพ ผู้ให้บริการเดินรถไฟฟ้าบีทีเอส หรือกรุงเทพมหานคร(กทม.) หรือกระทรวงมหาดไทย โดยต้องเจรจากับเจ้าของโครงการบีทีเอสในเรื่องการเดินรถ ซึ่งต้องเชื่อมต่อกัน หากขบวนรถไฟสามารถวิ่งผ่านหากันได้ เพื่ออำนวยความสะดวกให้ผู้โดยสารไม่ต้องเปลี่ยนขบวนรถ แต่เบื้องต้นกระทรวงคมนาคมได้เตรียมระบบการเดินรถให้เป็นอิสระต่อกันไว้ก่อน