อย่างไรก็ตาม การจัดเก็บรายได้ของ 3 กรมจัดเก็บภาษี สังกัดกระทรวงการคลังจัดเก็บได้ 650,755 ล้านบาท ต่ำกว่าประมาณการ 25,595 ล้านบาท (ร้อยละ 3.8)
สำหรับภาษีที่จัดเก็บได้ต่ำกว่าเป้าหมายที่สำคัญ ได้แก่ 1) ภาษีสรรพสามิตรถยนต์จัดเก็บได้ต่ำกว่าเป้าหมาย 10,888 ล้านบาท 2) ภาษีน้ำมันจัดเก็บได้ต่ำกว่าเป้าหมาย 10,389 ล้านบาท และ 3) อากรขาเข้าจัดเก็บได้ต่ำกว่าเป้าหมาย 7,316 ล้านบาท เนื่องจากมูลค่าการนำเข้าสินค้าที่ต่ำกว่าที่คาดการณ์ไว้ อย่างไรก็ดี ภาษีที่จัดเก็บได้สูงกว่าเป้าหมายที่สำคัญ ได้แก่ ภาษีสุราและภาษีเบียร์จัดเก็บได้สูงกว่าเป้าหมาย 5,051 และ 4,133 ล้านบาท ตามลำดับ เนื่องจากมีการปรับโครงสร้างภาษีสรรพสามิตสุราเมื่อเดือนก.ย.56
ในขณะที่รัฐวิสาหกิจนำส่งรายได้ 61,946 ล้านบาท สูงกว่าประมาณการ 12,355 ล้านบาท (ร้อยละ 24.9) และหน่วยงานอื่นจัดเก็บรายได้ 43,097 ล้านบาท สูงกว่าประมาณการ 9,891 ล้านบาท (ร้อยละ 29.8) เนื่องจากมีการนำส่งคืนรายได้ที่กันไว้เพื่อชดเชยให้แก่ผู้ส่งออกสินค้าจำนวน 5,929 ล้านบาท
ทั้งนี้ ในเดือนม.ค.57 รัฐบาลจัดเก็บรายได้สุทธิ 149,898 ล้านบาท ต่ำกว่าประมาณการจำนวน 12,106 ล้านบาท หรือร้อยละ 7.5 (ต่ำกว่าเดือนเดียวกันปีที่แล้วร้อยละ 8.3) โดยรายได้ของ 3 กรมจัดเก็บภาษี สังกัดกระทรวงการคลัง จัดเก็บได้ต่ำกว่าเป้าหมาย 14,849 ล้านบาท หรือร้อยละ 8.3
ภาษีที่จัดเก็บได้ต่ำกว่าเป้าหมายที่สำคัญได้แก่ 1) ภาษีเงินได้บุคคลธรรมดาจัดเก็บได้ต่ำกว่าเป้าหมาย 5,665 ล้านบาท หรือร้อยละ 17.0 ส่วนหนึ่งเป็นผลจากเมื่อมีการปรับลดอัตราภาษีแต่ฐานรายได้มิได้เพิ่มขึ้นตามที่ประมาณการไว้ เนื่องจากได้รับผลกระทบบางส่วนจากภาวะเศรษฐกิจมหภาคในประเทศ 2) ภาษีสรรพสามิตรถยนต์จัดเก็บได้ต่ำกว่าเป้าหมาย 2,801 ล้านบาท หรือร้อยละ 24.3 เนื่องจากมีการส่งมอบรถในโครงการรถยนต์คันแรกได้เกือบครบทั้งโครงการแล้วในปีงบประมาณ 2556 และ 3) ภาษีน้ำมันจัดเก็บได้ต่ำกว่าเป้าหมาย 2,439 ล้านบาท หรือร้อยละ 30.1 สาเหตุมาจากการขยายเวลาปรับลดภาษีน้ำมันดีเซลออกไปเพื่อช่วยเหลือค่าครองชีพของประชาชน
อย่างไรก็ดี รัฐวิสาหกิจนำส่งรายได้สูงกว่าประมาณการ 4,800 ล้านบาท หรือร้อยละ 48.9 โดยรัฐวิสาหกิจที่นำส่งรายได้สูงกว่าประมาณการที่สำคัญได้แก่ การประปาส่วนภูมิภาค โรงงานยาสูบ และบรรษัทบริหารสินทรัพย์สถาบันการเงิน