ทั้งนี้จากปริมาณการค้า ปริมาณนักท่องเที่ยว ปริมาณรถบรรทุก รถโดยสาร และรถยนต์ส่วนบุคคลที่มีเป็นจำนวนมาก และมีแนวโน้มเพิ่มสูงขึ้นอย่างต่อเนื่อง แต่พื้นที่การให้บริการมีจำกัดไม่เพียงพอทำให้เกิดปัญหาความแออัดจราจรติดขัด มีข้อจำกัดด้านการให้บริการอันเป็นปัญหาส่งผลกระทบถึงการค้าการท่องเที่ยว รวมถึงภาพลักษณ์ของประเทศ หลายรัฐบาลที่ผ่านมาเล็งเห็นถึงความสำคัญของการพัฒนาด่านศุลกากรสะเดา ที่เป็นด่านชายแดนทางบกที่มีความสำคัญที่สุดมีมูลค่าสินค้านำเข้า-ส่งออกสูงสุดในประเทศ เป็นประตูทางการค้าในการขนส่งสินค้าไปสู่ตลาดเอเชีย ภายใต้โครงการพัฒนาร่วมสามเหลี่ยมเศรษฐกิจ อินโดนีเซีย มาเลเซีย ไทย (Indonesia Malaysia Thailand Growth Triangle : IMT-GT) จึงมีแนวคิด ที่จะดำเนินการขยายพื้นที่ด่านฯ เพื่อแก้ไขปัญหาตลอดมา แต่ยังมิอาจบรรลุวัตถุประสงค์ได้ เนื่องจากติดขัดปัญหาความไม่ลงตัวในเรื่องแนวพื้นที่ขยาย งบประมาณและชุมชน
รัฐบาลมอบหมายให้จังหวัดสงขลาและกรมศุลกากรพิจารณาแก้ไขปัญหาความแออัดและแนวทางปรับปรุงพัฒนาให้รองรับปริมาณงานที่เพิ่มสูงอย่างต่อเนื่อง โดยโครงการก่อสร้างด่านศุลกากรสะเดาแห่งใหม่เริ่มดำเนินการมาตั้งแต่ปี 2539 แต่ก็ประสบปัญหาสำคัญเรื่องการจัดการพื้นที่มาโดยตลอด เกือบ 20 ปี จนมาในปี 2557 รองหัวหน้าฝ่ายเศรษฐกิจ คสช. มอบหมายให้กรมศุลกากรเร่งรัดดำเนินการโครงการก่อสร้างด่านศุลกากรสะเดาแห่งใหม่ อธิบดีกรมศุลกากรจึงได้มีการเจรจากับราษฎรฯ และขอความเห็นใจในการเจรจาที่ยืดเยื้อมาเป็นเวลายาวนานถึง 3 ครั้ง ในระยะเวลา 3 เดือน จนในที่สุดราษฎรยินดีรับข้อเสนอเพื่อรับเงินเยียวยาพร้อมกับมอบพื้นที่ทำกินคืน สปก. เพื่อนำไปให้กรมศุลกากรใช้ประโยชน์ในการพัฒนาโครงการก่อสร้างด่านศุลกากรสะเดาแห่งใหม่
โดยเมื่อวันที่ 20 ม.ค.58 คณะรัฐมนตรีมีมติเห็นชอบหลักเกณฑ์การจ่ายเงินชดเชยเพื่อเยียวยาราษฎรฯ ในพื้นที่โครงการก่อสร้างด่านศุลกากรสะเดาแห่งใหม่ และอนุมัติหลักการให้ใช้เงินงบประมาณรายจ่ายประจำปีงบประมาณ พ.ศ.2557 งบกลาง เพื่อแก้ไขปัญหาการจัดหาพื้นที่ดำเนินโครงการก่อสร้างด่านศุลกากรสะเดาแห่งใหม่ให้รองรับการขยายตัวทางเศรษฐกิจที่เพิ่มขึ้นอย่างต่อเนื่อง และเป็นการเตรียมความพร้อมก้าวไปสู่การเป็นประชาคมเศรษฐกิจอาเซียน (AEC) ที่จะถึงนี้ จึงจำเป็นต้องพัฒนาศักยภาพในทุกด้านมารองรับและเร่งดำเนินการก่อสร้างด่านศุลกากรสะเดาแห่งใหม่ให้แล้วเสร็จโดยเร็ว เพื่อการพัฒนาเศรษฐกิจของประเทศ อีกทั้งเพื่อรองรับเขตเศรษฐกิจพิเศษอำเภอสะเดา จังหวัดสงขลา ที่กำลังจะเกิดขึ้นอีกด้วย