กองทุนฯ ได้รับดำเนินการตาม พ.ร.ก.ปรับปรุงการบริหารหนี้ฯ ตั้งแต่เดือนตุลาคม 2555 เป็นต้นมา โดยเมื่อกองทุนฯ เริ่มดำเนินการมีภาระหนี้ต้นเงินกู้ FIDF1 และ FIDF3 รวมทั้งสิ้น 1,133,132 ล้านบาท ประกอบด้วยหนี้ FIDF1 จำนวน 463,275 ล้านบาท และหนี้ FIDF3 จำนวน 669,857 ล้านบาทจนถึงเดือนมิถุนายน 2558 กองทุนฯ ได้นำส่งเงินเพื่อชำระต้นเงินกู้ ดอกเบี้ย และค่าบริหารจัดการหนี้ FIDF1 และ FIDF3 รวม 227,654 ล้านบาท แบ่งเป็นการชำระคืนต้นเงินกู้ 99,794 ล้านบาท โดยชำระจากเงินของกองทุนฯ ที่ได้รับจากการรับชำระหนี้จากลูกหนี้ของกองทุนฯ และเงินปันผลจากสถาบันการเงินที่กองทุนฯถือหุ้นอยู่ รวมเป็นเงินทั้งสิ้น 97,268 ล้านบาท และสินทรัพย์คงเหลือจากบัญชีผลประโยชน์ฯ จำนวน 2,526 ล้านบาท สำหรับการชำระดอกเบี้ยและค่าบริหารจัดการ ได้ชำระแล้ว 127,849 ล้านบาท และ 11 ล้านบาทตามลำดับ โดยชำระจากเงินนำส่งจากสถาบันการเงิน
นอกจากนี้ในไตรมาส 4 ปีงบประมาณ 2558 คาดว่าจะมีการชำระคืนต้นเงินกู้และดอกเบี้ย FIDF1 และ FIDF3 เพิ่มอีก 34,547 ล้านบาท และ 8,140 ล้านบาท โดยเป็นเงินของกองทุนฯ จำนวน 24,547 ล้านบาท และเงินนำส่งจากสถาบันการเงิน จำนวน 18,140 ล้านบาทจากการชำระหนี้ดังกล่าว มีผลทำให้ภาระหนี้แรกเริ่มที่กองทุนฯ รับมาดำเนินการในระยะเวลา 3 ปี ลดลงเหลือต่ำกว่า 1.0 ล้านล้านบาท โดยมียอดคงเหลือทั้งสิ้นประมาณ 998,791 ล้านบาท ทั้งนี้ คาดว่าจะใช้เวลาในการชำระหนี้ที่เหลืออีกไม่น้อยกว่า 15 ปี