มาตรการด้านความปลอดภัย (Safety) จะมีดำเนินการแก้ไขทันที หากพบว่าโทรทัศน์วงจรปิด (CCTV) ขัดข้องหรือชำรุด นายสถานีเฝ้าระวังพื้นที่โดยผ่าน CCTV และควบคุมผ่านวิทยุสื่อสาร เน้นการก่อวินาศกรรมโดยให้เจ้าหน้าที่รักษาความปลอดภัยตรวจตราดูอาคารสถานที่ทำการ สถานี ห้องสุขา ที่จอดรถ ที่ติดตั้งหม้อแปลงไฟฟ้า ถังขยะ และพื้นที่ที่เป็นจุดลับตา และมีการจัดเจ้าหน้าที่รักษาความปลอดภัยบริเวณพื้นที่ที่เป็นจุดเสี่ยง และให้เดินตรวจตามจุดเสี่ยงทุก 1 ชั่วโมง ในทุก ๆ สถานี นอกจากนี้ จะตรวจทุกทางเข้า-ออกสถานีรวมถึงหากพบวัตถุต้องสงสัยให้แจ้งเจ้าหน้าที่สถานีหรือเจ้าหน้าที่รักษาความปลอดภัยทันที รวมถึงจัดชุดตรวจพื้นที่ภายในโรงซ่อมบำรุง พื้นที่แนวรั้ว สำหรับการกำหนดวัตถุต้องห้ามที่ไม่สามารถให้ผู้โดยสารนำเข้ามาในระบบมีดังนี้ อาวุธและของมีคมทุกชนิด ลูกโป่ง ดอกไม้ไฟ พลุ ประทัด และวัตถุไวไฟอื่นๆที่ก่อให้เกิดเปลวไฟ
มาตรการด้านความมั่นคง (Security) เจ้าหน้าที่รักษาความปลอดภัยสถานีพญาไทและสถานีราชปรารภ ประจำชั้นจำหน่ายตั๋วโดยสาร สุ่มตรวจด้วยเครื่องตรวจสอบโลหะมือ พร้อมไฟฉายส่อง ในอัตราส่วน 1:20 พื้นที่จอดรถใต้อาคารสถานีมักกะสัน เจ้าหน้าที่รักษาความปลอดภัยทำการตรวจรถที่เข้ามาจอดทุกคัน โดยทำการตรวจสอบฝากระโปรง ใต้ท้องรถ และจดบันทึกรถที่เข้า-ออก ทุกคัน และสังเกตรถที่มีลักษณะแปลกปลอมให้เฝ้าสังเกตเป็นพิเศษ ให้กำชับกวดขันเจ้าหน้าที่ที่เกี่ยวข้อง และเจ้าหน้าที่ผู้ที่อยู่ระหว่างปฏิบัติหน้าที่ คอยสอดส่องและระมัดระวังป้องกันเหตุอันตราย การก่อวินาศกรรมตามอาคาร สถานที่ จุดสำคัญต่างๆ รวมทั้งระมัดระวังการเกิดอัคคีภัย และภัยธรรมชาติตลอดเวลา ให้มีการตรวจสอบกระเป๋า หรือกล่องหีบห่อ สัมภาระที่วางทิ้งไว้ผิดสังเกต โดยไม่ทราบเจ้าของ หากพบให้รีบแจ้งเจ้าหน้าที่ที่เกี่ยวข้องทันที อย่าได้หยิบฉวยหรือเปิดดูเป็นอันขาด สำหรับความร่วมมือในการเข้าตรวจร่วมจากหน่วยงานภายนอก ได้มีการติดต่อประสานงานชุดสุนัขทหาร กรมการสัตว์ทหารบกที่ประจำการ ณ ท่าอากาศยานสุวรรณภูมิ เพื่อเข้าตรวจสอบพื้นที่ระบบรถไฟฟ้าด้วย
มาตรการด้านการติดต่อประสานงานกรณีเหตุฉุกเฉินและการตอบสนองต่อเหตุการณ์ เมื่อเกิดเหตุการณ์ที่ไม่ปกติ หรือเหตุการณ์ฉุกเฉินนั้น จะมีการประสานงานและติดต่อตามช่องทางที่กำหนดและซักซ้อมไว้ โดยศูนย์ควบคุมการเดินรถไฟฟ้า (OCC) จะทำหน้าที่เป็นศูนย์ประสานงาน อำนวยการ และติดตามสถานการณ์ สนับสนุนและประสานหน่วยงานที่เกี่ยวข้อง
อย่างไรก็ตาม (ช่วงวันที่ 17-18 สค. 58) มีชุดตรวจทหารสื่อสาร ทหารสังกัดปืนใหญ่ 12 รักษาพระองค์ ปราจีนบุรี ชุดทหารส.พัน1รอ. และการเข้าตรวจพื้นที่ของทางตำรวจรถไฟ นำโดยพลตำรวจตรี จิรสันต์ แก้วแสงเอก ผู้บังคับการตำรวจรถไฟ ได้เดินทางเข้ามาตรวจและเยี่ยมชมความพร้อมการรักษาความปลอดภัยระบบรถไฟฟ้าแอร์พอร์ต เรล ลิงก์ และเข้าร่วมประชุมหารือกับส่วนงานรักษาความปลอดภัยของบริษัทฯ ทั้งนี้เพื่อเพิ่มความมั่นใจแก่ผู้โดยสารที่มาใช้บริการในระบบรถไฟฟ้าแอร์พอร์ต เรล ลิงก์
นายภากรณ์ กล่าวต่อว่า รถไฟฟ้าแอร์พอร์ต เรล ลิงก์ ยังคงให้บริการตามปกติ โดยเปิดให้บริการตั้งแต่เวลา 6.00-24.00 น. และจะยังคงใช้มาตรการการรักษาความปลอดภัยขั้นสูง หากผู้ใดพบเห็นสิ่งผิดปกติ หรือไม่น่าไว้วางใจให้รีบแจ้งเจ้าหน้าที่ประจำสถานีโดยทันที