อย่างไรก็ตามยังคงมีประชาชนบางกลุ่มแสดงความกังวลต่อการดำเนินโครงการฯ ซึ่งคณะอนุกรรมการฯ ได้มีการรวบรวมข้อคิดเห็นต่างๆ รวมถึงความต้องการ ผลกระทบต่อทุกภาคส่วน ตลอดจนข้อเสนอแนะจากประชาชนและสื่อมวลชน เพื่อเป็นข้อมูลให้แก่บริษัทที่ปรึกษาใช้ประกอบการประมวลแนวคิดการออกแบบให้สอดคล้องกับความต้องการและคุ้มค่ามากที่สุด นอกจากนี้กทม.จะดำเนินการศึกษาผลกระทบสิ่งแวดล้อม (EIA) และกำหนดมาตรการป้องกันและแก้ไขผลกระทบสิ่งแวดล้อมควบคู่ไปด้วย แม้ว่าโครงการดังกล่าวจะไม่เข้าข่ายต้องจัดทำรายงาน EIA แต่เพื่อเป็นประโยชน์ต่อการดำเนินโครงการและใช้เป็นข้อมูลเปิดเผยต่อสาธารณชนได้ ในส่วนของการให้ความช่วยเหลือประชาชนที่อาศัยอยู่บริเวณริมแม่น้ำเจ้าพระยาที่ได้รับผลกระทบจากโครงการฯ มี 3 ทางเลือก ได้แก่ รัฐจัดหาที่พักอาศัยใหม่ในพื้นที่ใกล้เคียง รัฐจัดหาโครงการที่อยู่อาศัยของรัฐที่มีอยู่แล้วให้แก่ผู้ได้รับผลกระทบ หรือรัฐจ่ายเป็นเงินช่วยเหลือตามหลักเกณฑ์ที่คณะรัฐมนตรีกำหนด
สำหรับขั้นตอนการจ้างที่ปรึกษาฯ นั้น กทม.ได้ออกประกาศเชิญชวนผู้สนใจแสดงความจำนงและยื่นเอกสารเบื้องต้น และได้มีการตรวจสอบคุณสมบัติผู้ยื่นเอกสารฯ เสร็จแล้ว โดยมีผู้มีคุณสมบัติตรงตามประกาศและรายการข้อกำหนดการจ้าง (TOR) จำนวน 2 ราย ซึ่งกทม.จะได้ออกหนังสือเชิญบริษัทที่ปรึกษายื่นข้อเสนอด้านเทคนิคและด้านราคาต่อไป โดยคาดว่าจะลงนามสัญญาจ้างที่ปรึกษาได้ในเดือนพ.ย.58