นินเทนโด ประสบภาวะขาดทุนสุทธิ 4.32 หมื่นล้านเยนในปีงบการเงิน 2554 ถือว่าเป็นการขาดทุนครั้งแรกนับตั้งแต่บริษัทเริ่มเปิดเผยผลประกอบการเมื่อปี 2524 หรือกว่า 30 ปีที่แล้ว เนื่องจากยอดขายเครื่องเกมซบเซาอย่างหนัก ขณะเดียวกันก็ได้รับผลกระทบจากเงินเยนที่แข็งค่าอย่างมาก
ในปีงบการเงิน 2554 นินเทนโดมีตัวเลขขาดทุนจากการดำเนินงาน 3.732 หมื่นล้านเยน จากยอดขาย 6.4765 แสนล้านเยน หรือร่วงลง 36.2% จากปีก่อนหน้า
อย่างไรก็ดี ในปีงบการเงินปัจจุบันที่จะสิ้นสุดในเดือนมีนาคมปีหน้า นินเทนโดคาดการณ์ว่าจะมีกำไรสุทธิ 2 หมื่นล้านเยน จากยอดขาย 8.20 แสนล้านเยน หรือเพิ่มขึ้น 26.6% จากปีที่แล้ว เนื่องจากในปีนี้จะมีการเปิดตัวเกมใหม่ๆหลายเกม รวมถึงเครื่องเกม Wii U ที่มาพร้อมกับจอทัชสกรีน สำนักข่าวเกียวโดรายงาน