นายโยชิฮิเดะ สึกะ เลขาธิการหัวหน้าคณะรัฐมนตรีญี่ปุ่นกล่าวในการแถลงข่าวว่า "ในฐานะนักการเมืองที่เคยดำรงตำแหน่งนายกรัฐมนตรี การกระทำดังกล่าวปราศจากการไตร่ตรองอย่างมาก และถือเป็นเรื่องน่าเศร้าอย่างยิ่ง เราจึงต้องวิพากย์วิจารณ์เขาอย่างหนัก"
ทั้งนี้ รัฐบาลญี่ปุ่นเคยเตือนนายฮาโตยามะไม่ให้ไปเยือนไครเมีย โดยระบุว่าการเดินทางโดยใช้วีซ่าของรัสเซียนั้น ขัดแย้งกับท่าทีของญี่ปุ่นกรณีการผนวกไครเมีย และขัดต่อกฎหมายนานาชาติ
ด้านนายมาซาฮิโกะ โคมูระ รองประธานพรรคแอลดีพีกล่าวว่า การเดินทางดังกล่าวเป็นเรื่องที่น่าเสียใจ เพราะสวนทางกับสถานะของญี่ปุ่น ที่จะไม่ยอมรับความพยายามเปลี่ยนแปลงสถานการณ์ด้วยการใช้กำลัง
นายโคมูระกล่าวว่า "การไปเยือนไครเมียจะสร้างความเข้าใจผิดในประชาคมนานาชาติ" สำนักข่าวเกียวโดรายงาน